Also laut Datenblatt hat die CPU AES-NI, also hardware beschleunigtes AES.
Welches Remote-Desktop nutzt du denn?
Wie genau prüfst du die CPU Last?
Wieviel Speed/CPU hast du bei
http://cdn8.appwork.org/speed.zip ?
Geh mal in deinen JDownloader Ordner und bennene dort den jre/java Ordner in irgendwas anderes um, damit JDownloader das System-Java nutzt. JDownloader vorher beenden.