Das Probelm wurde erkannt.
Wenn man auf "neuen Link hinzufügen" drückt, erscheint ein neues Fenster in dem man den Link einfügt (wenn er nicht schon automatisch drin steht). Jetzt gibt es links unten in der Ecke den Punkt "Angaben überschreiben Paketverwalterregeln". Dieser Punkt MUSS deaktiviert sein! Dann bleibt alles beim alten und es wird für jeden Link ein Ordner erstell.