Ich würde vorschlagen wir schauen uns das mal gemeinsam via Teamviewer an. Schick mir einfach ID und PW an
support@jdownloader.org
Von dem was du berichtest würde ich auf zuwenig Speicher schließen.
Was genau meinst du mit Backup? Backup der Linklisten oder wie genau spielst du ein Backup zurück?